Marinen består av förband som ständigt rör sig runt Sveriges kust och finns där de behövs. På tre ställen finns dock baser där de marina förbanden utgår ifrån.
Stockholm
Området kring Hårsfjärden har varit viktigt för Marinen i flera hundra år. På Berga har sjöstridskrafterna förtöjt under lång tid. Idag finns såväl 4.sjöstridsflottiljen som Stockholms amfibieregemente där. Härifrån kan man enkelt nå viktiga bas- och övningsområden samt skjutfält men också enkelt nå Gotska sjön och Norra Östersjön.
På Muskö finns viktiga varvsresurser och dockor som drivs av Saab Kockums. Marinstaben som leder marinens verksamhet, finns också här. Delar av verksamheten är skyddad genom att den finns inne i Musköberget.
Göteborg
Även Göteborg har huserat marina verksamhet länge. Numera representeras marinen av Älvsborgs amfibieregemente som återuppstod 2021. Tidigare fanns även ytstridsfartyg baserade här. Älvsborgs amfibieregemente ligger alldeles intill Göteborgs hamn som är en av Nordens största och viktigaste.
Norr om Göteborg, i närheten av Uddevalla, har röjdykardivisionen sin utbildningsplats. Där kan alla former av dykutbildning genomföras, även på stora djup.
Karlskrona
Genom århundradena har Karlskrona varit navet för den svenska marinens verksamhet och har haft en betydande roll i att trygga Sveriges marina försvar och intressen. Staden fungerar som en viktig bas för marinens fartyg och personal.
En av de mest framträdande faktorerna i Karlskronas betydelse för den svenska marinen är dess strategiska geografiska läge. Beläget vid Östersjöns kust, ger Karlskrona möjlighet till snabb och enkel tillgång till södra Östersjön och Östersjöinloppen. Detta underlättar marina operationer, inklusive övervakning av territorialvatten, bevakning av sjöfartsrutter, och skydd av kustlinjen.
Idag är Karlskrona hemmabas för 1.ubåtsflottiljen och Tredje sjöstridsflottiljen med sina ubåtar, ytstridsfartyg och minröjningsfartyg. Dessutom är det bas för en av två marina basbataljoner som ingår i Marinbasen. Dessa svarar för logistikförsörjningen av för krigsförbanden och stridsfartygen. På basen finns också verkstäder för underhåll av tyngre vapen. Här sker också utbildning av värnpliktiga och officerare i Sjöstridsskolans regi.
På Saab Kockums nybyggs bland annat ubåtar och översyn görs på marinens fartyg. Här finns bland annat torrdockor och verkstäder.
